スカイマーク（BC）は2015年11月6日、オンライン宿泊予約サービス「Booking.com（ブッキング・ドットコム）」を運営するBooking.com B.V社と、オンライン宿泊予約に関するアフィリエーション・パートナーシップ契約を締結した。
これにより、スカイマークのウェブサイトに宿泊予約専用のメニュー（ナビゲーションタブ）が配置された。利用者は航空券の手配と同時に「ブッキング・ドットコム」の宿泊予約機能にアクセスすることができるようになった。言語は日本語以外に英語、中国語、韓国語に対応している。
なお、ブッキング・ドットコムによる国内航空会社との業務提携は、全日空（NH）、日本航空（JL）、ピーチ・アビエーション（MM）、バニラ・エア（JW）、スカイネット・アジア航空（ソラシドエア／6J）に次いで6社目となっている。
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